目的 分析1株多黏菌素和替加环素均耐药的肺炎克雷伯菌基因组特征。方法 肺炎克雷伯菌KP2016分离自我院临床痰液标本。采用微量肉汤稀释法测定KP2016对亚胺培南、美罗培南、多黏菌素和替加环素的最低抑菌浓度。对菌株进行第二代Illumina和第三代Oxford Nanopore全基因组测序。通过Unicycler对第二代和第三代序列进行混合拼接。通过ABRicate v0.8.13调用Resfinder数据库分析耐药基因。通过ISFinder分析移动元件。利用CGE(Center for Genomic Epidemiology)网站分析菌株的ST型和质粒复制子类型。利用Proksee对质粒结构进行可视化。结果 KP2016菌株对多黏菌素和替加环素均耐药，MIC分别为512和16 mg/L。MLST分析显示KP2016属于ST656，携带多黏菌素耐药相关mcr-1和mcr-8基因和替加环素耐药相关tmexCD1-toprJ1基因簇。KP2016携带1个染色体和5个环形质粒，质粒大小3,991～275,345bp,GC含量44.35%～52.20%。mcr-1基因位于约44kb的质粒p1上，上下游环境为ISKpn26-mcr-1-pap2-ISApl1;mcr-8基因位于IncR/IncN型质粒p2上，遗传结构为ISEcl1-mcr-8-orf-ISKpn26;tmexCD1-toprJ1基因簇结构为IS26-tnfxB1-tmexC1-tmexcD1-toprJ1。此外，菌株还携带多黏菌素耐药相关的染色体介导的CrrB突变(L204V、V237I)。结论 肺炎克雷伯菌KP2016多黏菌素耐药由mcr-1、mcr-8和crrB突变介导，替加环素耐药由tmexCD1-toprJ1基因簇介导。应加强合理监测，防止其在医疗机构中进一步传播。
