紫花苜蓿生长调节因子互作因子GIF基因家族的鉴定与分析

2024-06-21 30 1.64M 0

  摘要:生长调节因子互作因子GIF(GRF-Interacting Factor)是植物中一类具有SSXT(SNH)保守结构域的共转录激活因子,与生长调节因子GRF(Growth-Regulating Factor)共同参与调节植物生长发育、生殖发育、形态结构建成和逆境胁迫响应等生理过程。紫花苜蓿(Medicago sativa)是重要的牧草种类,生长发育和形态结构直接影响牧草产量。前人已研究报道了紫花苜蓿MsGRF基因家族,但对GIF基因家族仍缺乏系统了解。本研究通过生物信息学分析,对紫花苜蓿“新疆大叶”(Medicago sativa cv. ‘Xinjiang Daye’)GIF基因家族进行鉴定与分析,为探究MsGIFs的功能和苜蓿遗传改良及新品种创制奠定基础。分析结果表明,在全基因组发现MsGIF基因17个,基因大小为156~702 bp,不均匀地分布在14条染色体上,可进一步分为三个亚家族。此外,MsGIFs氨基酸序列长度在51~233 aa之间,蛋白质分子量在5773.55~24996.80 Da之间,蛋白质等电点在5.07~6.49之间,均是亲水性蛋白质,亚细胞定位预测结果表明多在细胞核,与其基因表达调控功能一致。本文还对MsGIF基因家族基因结构、蛋白质二级和三级结构、启动子顺式作用元件及物种内基因共线性关系进行分析。为探究GIF在牧草生长发育和株型建成等过程中的生物学功能提供一定的参考。

  文章目录

  1结果与分析

  1.1 MsGIF基因家族的鉴定及染色体定位

  1.2 GIF系统进化分析

  1.3 MsGIF蛋白理化性质分析

  1.4 MsGIF氨基酸Motif、蛋白质保守结构域、基因结构分析

  1.5 MsGIFs蛋白质二级和三级结构分析

  1.6 MsGIF启动子顺式作用元件分析

  1.7 MsGIF基因共线性分析

  2讨论

  3材料与方法

  3.1紫花苜蓿GIF基因家族的鉴定

  3.2基因在染色体上定位分析

  3.3系统进化分析

  3.4蛋白理化性质分析

  3.5 氨基酸Motif、蛋白质保守结构域和基因结构分析

  3.6蛋白二级和三级结构分析

  3.7顺式作用元件分析

  3.8基因重复和共线性分析



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