为鉴定不同饲养方式下牦牛皮下脂肪组织中差异表达的微小RNAs(miRNAs)，本试验采用高通量测序对不同饲养方式下牦牛皮下脂肪组织中的miRNAs进行筛选，运用DESeq分别鉴定出自然放牧18月龄（G18） vs （从自然放牧18月龄开始舍饲育肥6个月至24月龄）F24、G18 vs （自然放牧至24月龄）G24和F24 vs G24皮下脂肪组织中差异表达的miRNAs，对差异表达的miRNAs进行靶基因预测分析。在9个牦牛皮下脂肪组织中共鉴定出1158个miRNAs，其中已知miRNAs 731个，新预测miRNAs 427个。在G18 vs F24中有43个差异miRNAs，预测到的靶基因2436个；在G18 vs G24中有68个差异miRNAs，预测到的靶基因3559个，在F24 vs G24中有31个差异miRNAs，预测到的靶基因1456个。对预测到的基因进行GO和KEGG富集分析，其主要富集到了脂肪酸代谢过程、脂肪酸生物合成过程、脂肪酸生物氧化、不饱和脂肪酸代谢过程和脂肪细胞分化调节等。因此，枯草期对牦牛进行补饲有利于牦牛皮下脂肪组织沉积。
