基于SCoT分子标记的圆叶小石积遗传多样性分析

2024-04-02 220 1.13M 0

圆叶小石积(Osteomeles subrotunda)是浙江省极小种群野生植物和省重点保护野生植物,分布区域十分狭窄,植株数量稀少,该植物亟待保护。本研究在叶片样品采集、DNA提取、PCR反应体系优化和引物筛选的基础上,利用SCoT分子标记研究圆叶小石积的遗传多样性。结果表明,从36条引物中筛选到8条重复性高、多态性好、条带清晰的SCoT引物,共扩增出220个条带,其中多态性条带219个;物种水平上,多态性比率(PPB)为99.55%,观测等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Nei′s基因多样性指数(H)和香农信息指数(I)的均值分别为1.995 5、1.473 1、0.284 7和0.437 3,具有较高的遗传多样性水平;居群水平上,PPB、遗传分化系数(Gst)和基因流(Nm)分别为37.57%、0.591 7和0.345 0,表明居群间的基因交流较少,大部分变异发生在居群内;UPGMA聚类结果表明,6个居群可分为6组,蛤蜊湾(GLW)样品与其余样地的关系最远,与主成分分析结果一致。圆叶小石积遗传多样性研究,为后续开展该物种的保护和应用打下了基础。



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